Бывший министр иностранных дел Ирана Мохаммад Джавад Зариф заявил в посте на X, что «иранцы отразят любого агрессора, не говоря уже о каком‑то геноцидальном трусе, который понятия не имеет, что начал» и подчеркнул, что, хотя Иран не начал эту войну, именно он решит, как она закончится . По его словам, за последние три века Иран не нападал на другие государства, но неизменно защищал себя . Также Зариф подчеркнул ценность национального интеллекта: «Здания могут быть разрушены, но знания – нет, особенно при девяносто миллионах патриотичного и преданного человеческого потенциала».

Между тем Иран обвинил генерального директора МАГАТЭ Рафаэля Гросси в бездействии относительно ударов Израиля и заявил о намерении предпринять юридические шаги . Глава Организации атомной энергии Ирана Мохаммад Эслами осудил «повторяющиеся жестокие атаки сионистского режима» по ядерной инфраструктуре Ирана, включая тяжеловодный реактор Арака, несмотря на контроль МАГАТЭ .

В формальном письме от 13 июня Эслами потребовал от Гросси «немедленно прекратить бездействие, осудить нарушения сионистского режима и выполнить свои уставные обязанности». Старший советник Верховного лидера Али Лариджани предупредил, что после войны Гросси будет привлечён к ответственности .

Премьер-министр Израиля Биньямин Нетаньяху разъяснил, что Израиль не стремится к смене режима в Иране: «Это может быть результатом, но определённо это не заявленная и официальная цель» .

Иран категорически отверг утверждения Израиля о нанесении удара по больнице — Mehrnews сообщило: «Иран категорически опровергает ложное заявление сионистов о том, что больница была целью удара», и подчеркнул, что его оборонительные действия полностью соответствуют международному праву, направлены лишь против тех, кто участвует в незаконной агрессии .